Действие повествования разворачивается в не столь отдаленном будущем, в шумном городе Хартленд. В этой городской обстановке мы встречаем Юму Цукумо, начинающего дуэлянта, мечтающего получить титул чемпиона Duel Monsters, несмотря на его статус новичка. В один роковой день, во время ожесточенной дуэли с однокурсником-хулиганом, перед Юмой материализуется таинственное эфирное существо по имени Астрал. Ко всеобщему удивлению, Астрал помогает Юме добиться победы. После этой встречи Астрал раскрывает Юме свою загадочную цель: он пытается вернуть свои утраченные воспоминания. Эти воспоминания приняли форму 99 карточек «Xyz Monster», известных как «Числа», и разбросаны по всему миру. Крайне важно отметить, что эти «Числа» обладают уникальной способностью — они могут влиять и манипулировать желаниями дуэлянтов, которые ими владеют, часто выдвигая на передний план их самые темные порывы. Пытаясь вернуть свои утраченные воспоминания и собрать разбросанные карты «Числа», Астрал заключает союз с Юмой. Вместе они отправляются в путешествие, наполненное дуэлями с высокими ставками, стремясь собрать воедино фрагментированное прошлое Астрала, одновременно противодействуя злонамеренному влиянию «Чисел» и их коварной власти над дуэлянтами.